Озеро Черное располагается в пределах Ширинского района на северо-востоке Хакасии в непосредственной близи к поселку Черное озеро. Расстояние до курорта «Озеро Шира» около 30 километров пути. Долина озера раскинулась у подножия невысоких гор, возвышающихся над зеркалом Черного всего на 2 сотни метров и подбирающихся довольно близко к побережью водоема. На западе долина прижимается к Койбальской степи, лишенной деревьев, бугристой, каменистой и песчаной, растительность ее редка и невзрачна.
Форма водоема - овальная, максимальная протяженность Черного равна 2,5 километра, а глубина - 5 метров. Дно озера пологое, укрытое песком или илом, местами глинистое и вязкое, но в целом спокойное. Побережье скорее топкое, на юге заболочено и засолено. Летом осадки редки, а потому без того сухая и каменистая степь значительно нагревается.
Горы у подножия опоясаны десятком родников, миниатюрных настолько, что в период летней засухи они пересыхают, в обычное время вода в них соленая. Исключением является место, удаленное на 2 метра к северу от Черного, где находятся бьющая скважина и родник. Активны они круглогодично, степень их минерализации невысока, а вода пригодна для питья.
Вода в самом Черном - слабощелочная. Натриевая, хлоридно-сульфатная, содержание в ней кальция ничтожно мало, этим она и отличается от многих южно-хакасских минеральных водоемов. А вот солей в ней предостаточно - почти 8 граммов на литр, показатель этот стабилен на протяжении всей площади и глубины озера. В воде также присутствует ряд иных микроэлементов и химических соединений. В период засухи Черное мелеет, что визуально прекрасно заметно. В это же время степень минерализации снижается.
Донные отложения занимают практически всю площадь Черного, наибольшая мощность приходится на центр водоема, где достигает 3,5 метров. В отложениях характерны органические остатки. Прибрежная акватория лишь частично укрыта ими, смешана с глиной и песчаными частичками. А местами ила на дне почти нет.
Согласно исследованиям, отложения на дне Черного наделены лечебными свойствами, в составе присутствуют йод, сульфаты, гидрокарбонаты.
