Музей природы Заповедника "Хакасский" открыт в 2009 году. Здесь посетителей знакомят с флорой и фауной заповедника «Хакасский», его водно-болотными угодьями, а также историей семьи староверцев Лыковых.
В музее действует пять тематических зон. Зона №1 оформлена большой картой республики с участками заповедника: она посвящена территориальной структуре заповедника. Участки заповедника обозначены на карте цветной подсветкой. Сверху карта дополнена плазменной панелью, на которой автоматически с подсветкой запускается видеоряд с ландшафтами участка.
Зона №2 рассказывает о степной части заповедника: на стендах расположена информация о флоре и фауне степных участков, встроенные в стену плазменные панели демонстрируют слайды, фрагменты фильмов и иную наглядную информацию. Здесь же располагаются деревянные скульптуры птиц и зверей: сокола-балобана, суслика, лебедя, барсука. В зоне №3 экскурсия продолжается рассказом о водно-болотных угодьях, перелетных птицах и сезонных миграциях. Далее посетители переходят в горно-таежную зону экспозиции, зону №4. В выставочной полосе вдоль информационной стены располагаются не только травянистые растения, но и кустарники. Кроме того, в этой выставочной полосе размещены деревянные фигуры кабарги и пары тетеревов.
Завершается экскурсия в зоне № 5 - «Угрозы заповеднику», то есть браконьеры, пожары, мусор. Инсталляция содержит не только информационные стенды, но и вписанные в общий дизайн реальные орудия браконьерского лова, муляжи оружия, а также манекен государственного инспектора. Здесь же располагается ростовая пластиковая фигура злобного браконьера, который пытается нарушить заповедную территорию.